Als Sektion ist der Verein Natur Horgen Mitglied der Verbände ZVS/BirdLife Zürich (Verband der Naturschutzvereine in den Gemeinden) und Schweizerischer Vogelschutz SVS/BirdLife Schweiz. BirdLife Schweiz wiederum ist Gründungsmitglied von BirdLife International, dem weltweit grössten Naturschutzverband.
In der Region Zimmerberg sind unsere Partnervereine
Natur- und Vogelschutzverein Singdrossel, Langnau am Albis
Natur- und Vogelschutzverein Oberrieden
Naturschutz Richterswil-Samstagern
Natur- und Vogelschutzverein Thalwil
Die verschiedenen Natur- und Vogelschutzvereine aus der Region bilden die Trägerschaft des Projekts Wiesel & Co am Zimmerberg, welches die stark bedrohten Zielarten Hermelin, Mauswiesel und Iltis fördern will.